Windows編 / Windows

Windowsの環境構築についてです．

  1. Windowsのアプリケーションのインストール
    • メール：お好きなものをどうぞ．例えば，
      • Thunderbird
      • Outlook
    • ブラウザ
      • Google chrome
      • Firefox
    • オフィス
      • Microsoft office：九大の情報統括本部のサイトから取得
    • セキュリティソフト
      • ウイルスバスター（2021/2/8現在）：九大の情報統括本部のサイトから取得．
    • テキストエディタ：好みのエディタを利用ください．例えば，
      • Sublime text：必要なパッケージをインストールする（日本語化についてはURLを参照）
      • Visual Studio Code
      • さくらエディタ
    • Remote desktop
      • Microsoft remote desktop：windowsを遠隔操作可能（九大はvpn環境がないため，学内限定で利用可能）
      • その他，遠隔操作に必要なアプリケーションを各自の好みで利用
    • 画像編集ソフト：下記は有料ソフトのため，学生の場合は要検討
      • Affinity designer
      • Affinity photo
    • pdf
      • Adobe acrobat reader
    • GIS
      • QGIS
      • ArcGIS
    • FTPソフト
      • Filezilla：色々FTPソフトはありますが，私はこれを利用しています．Windows，Mac，Linuxで統一出来るため．
      • WinSCP
    • 解凍・圧縮ソフト
      • 各自が使いやすいソフトをインストールしておくと良い
        • 例えば，Lhaplusとか
    • その他，アプリケーション
      • HFS+ for Windows by Paragon Software：HDDのフォーマットがHFS+（Mac用）となっているものをWindowsで読み書き出来るようにするソフトウェア．有料．
      • SWAT：準分布型流出モデル．フリー．使えるようになりたいと思いつつ，現時点ではまだ使えてない．．．これから勉強します．．．
      • BunBackUp：バックアップ用ソフトウェア．フリー．
    • 計算環境
      • 下記で記載する例えば，”~/.bashrc”の編集など，ターミナル上でのコマンドについては，コマンド関係も参照しながら実行すること．
      • C言語，Fortran：簡単にインストールするには，Windows Subsystem for Linux（Ubuntu, 以下WSL）が便利．以下にインストール方法を列記する．
        • WSLのインストール
          • ここの「手動インストールの手順」の「手順1」を参考にLinux用Windowsサブシステムを有効にする．その後，PCを再起動する．
          • Microsoft Storeで「Ubuntu」と検索し，ダウンロード，インストールする．
            • インストール時にmicrosoftアカウントへのログインを促されるが，ログインしなくて問題ない．
          • その後，スタートメニューに作成される「Ubuntu」を起動し，インストール完了を待つ．
          • Ubuntuで使用する「ユーザー名」と「パスワード」を聞かれるので，入力し設定する．なお，パスワードは入力しても表示されないことに注意．
          • Ubuntuの初期設定は，Linux編と同様に行えばOKなので，そちらを参照．ただし，「環境構築関係」の部分は，「パッケージリストの更新，インストールされているパッケージの更新」を除き不要．
          • Ubuntuでのディレクトリ構成？はWindowsとは異なる．例えば，よく利用するHDD（例えば，Dドライブなど）は，”/mnt/d”といったディレクトリとなっている．
            そのため，UbuntuでWindowsで利用している簡単に？素早く？データにアクセスしやすくするには，Ubuntuのホームディレクトリにリンクを貼ってよくと良い．リンク情報は”~/.bashrc”に記載しておけば，Ubuntu起動時に自動的に反映される．
            “~/.bashrc”の編集方法は，コマンド関係を参照のこと．
            リンク情報は以下を参考に”~/.bashrc”に自分のPC環境に合うように記載すること．
            if [ -d winc ] ; then
                       echo “Windows shared folders ready”
            else
                       ln -s /mnt/c winc
            fi
          • WSLをGUIで利用したい場合は，VcXsrvをインストールすると良い．インストールについては，ここを参照．
      • wgrib2のインストール：WSL上で行うこと．
        • FCとCCの設定
          • “~/.bashrc”にFCとCCを以下を書き込み設定する（sudo vim ~/.bashrc）
            export FC=gfortran
            export CC=gcc
        • wgrib2のダウンロード：wget ftp://ftp.cpc.ncep.noaa.gov/wd51we/wgrib2/wgrib2.tgz
        • wgrib2の解凍：tar -xvzf wgrib2.tgz
        • 解凍したwgrib2内へ移動：cd grib2
        • makeの実行：make
        • 解凍したwgrib2の外のディレクトリへ移動：cd ../
        • wgrib2のフォルダを”/usr/local/”へ移動：sudo mv grib2 /usr/local
        • “~/.bashrc”にwgrib2のpathを通す：
          ・sudo vim ~/.bashrc
          ・”~/.bashrc”内の一番最後の行に
          # — wgrib2 —
          export WGRIB2=”/usr/local/grib2″
          export PATH=”${WGRIB2}/wgrib2:${PATH}”
          #—————
        • “~/.bashrc”の更新：source ~/.bashrc
      • Anaconda：python環境構築用．Anacondaが企業での利用は有料になったようですが，2021/2/8時点では研究用途ではフリーで利用可能．有料になった場合はAnacondaを使わずに，自分でpip等で環境構築が必要になる．
        • Ubuntu（WSL）上へのAnacondaのインストールは，Linux版を利用．インストールファイルのダウンロードは，
          • wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh
            で可能．（2021/4/20時点で最新のインストールファイル）
          • インストール方法は
            ・bash ./Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh
            で可能．
        • pythonで別途インストールが必要なライブラリは”2.python”を参照．
      • Intelコンパイラ：2023/1/10時点でIntelコンパイラ（intel oneapi）が無償で利用可能になっているので（サポートなし），Ubuntu（WSL）上にもインストールすると良い．
        • こちらを参考にすればインストール可能．
  2. python
    • 環境構築
      • Anacondaをインストールする．
        • Windows版の64-Bit Graphical Installerをダウンロードすること．
        • 途中でチェックを入れる画面が出てくるので，”Add Path ···”というところにチェックを入れる．標準ではチェックが外れているので，注意．
      • Anacondaをインストール後は，不要なライブラリをインストールするのを防ぐために，
        ・conda config –append channels conda-forge
        を実行する．
      • ライブラリは極力condaとpipどちらかでインストールすべき．
        ただし，たまにcondaでインストールできないライブラリが存在する（探すのに時間がかかる？）ので，その場合は，pipでインストールする．
        Anaconda環境でのcondaとpipでの違いはここが参考になる．
    • ライブラリ：下記はあると便利なライブラリ．その他，必要に応じてインストールすべし．
      • natsort：natural sortをするのに利用
        ・pip install natsort
      • pygrib：gribのreadに利用
        ・pip install pygrib
      • pyproj：座標系変換等に利用（座標系・空間参照のデータベースの参照先のエラーが多い？）
        ・conda install pyproj
      • gdal : 座標系変換等に利用
        • まず以下のコマンドで”libgdal-dev”をインストールする．
          ・sudo apt install libgdal-dev
        • その後，インストールした”libgdal-dev”のバージョンを以下のコマンドで確認する．
          ・apt search libgdal-dev
          出力される結果は以下のような形となるはず．
          * libgdal-dev/bionic,now xx.xx.xx+dfsg-1~bionic0 amd64（xx.xx.xxがバージョン）
        • 上で確認したバージョンに該当するgdalを以下のコマンドでインストールする（xx.xx.xxがバージョン）
          ・pip install gdal==xx.xx.xx
      • netcdf4：netcdfのreadに利用
        ・conda install netcdf4
      • spotpy：数値モデルのパラメータ同定に利用
        ・pip install spotpy
      • cartopy：各種地図作成に利用
        pipでインストールする際に，”geos_c.h no such file or directory”と言われるので，まず”libgeos-dev”を以下のコマンドでインストールする．
        ・sudo apt -y install libgeos-dev

        その後，以下のコマンドを実行し，インストールする．詳細はここを参照．
        ・pip install git+https://github.com/SciTools/cartopy.git

      • geopandas：shapefile等を扱うのに利用
        ・pip install geopandas
      • sh：terminal上でのコマンドと同様なコマンドで実行が可能となる．
        ・conda install sh
      • staticmap：pythonでopenstreetmapを利用が可能となる．（cartopyでも可能）
        ・pip install staticmap

 

2023/4/17　更新